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申请人须首先取得内地相关部门发出的营业执照及批准文件，可在内地营运过境巴士及过境出租汽车服务（如适用）。当粤港两地政府决定接受过境巴士或过境出租汽车配额的申请时，香港特别行政区政府运输署会在本地报章刊登通告，邀请符合资格的申请人，向运输署及广东省人民政府口岸办公室陆空口岸处递交申请，所有申请将由两地政府审批。
当申请人获两地政府分发过境巴士或过境出租汽车配额后，须分别在香港及内地完成办理有关手续，并在指定时间内开始提供过境巴士或过境出租汽车服务。
过境巴士方面，申请人在香港须根据运输署当时对非专营巴士的规定，向运输署申请客运营业证及客运营业证证明书，并在获签发相关证明文件后，方可开办过境巴士服务。所有过境巴士服务在香港境内的行走路线及上落客站点，均须获得运输署批准。
(有关申请客运营业证以营办非专营巴士服务的详情，请参阅此网页：)
过境出租汽车方面，申请人在香港须根据运输署当时对出租汽车的规定，向运输署提交出租汽车许可证 - 私家(豪华房车)(过境服务) 的申请，并在获签发许可证后，方可开办过境出租汽车服务。
(有关申请出租汽车许可证的详情请参阅以下网页：
出租汽车许可证常见问题
出租汽车公用表格)
(有关内地对过境车辆的规管及手续，请向内地有关部门查询或参考以下网页：http://gdga.gd.gov.cn/)
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